UV-sterilisoija perustuu veden läpivirtaukseen runkoputken sisällä. Vedessä olevat bakteerit altistuvat korkeaenergiselle ultraviolettisäteilylle. Säteily pilkkoo bakteerin rakenteen, estäen sitä lisääntymästä tai aiheuttamasta haittavaikutuksia. Veden virtausnopeuden on pysyttävä suosituksen alapuolella, jotta altistusaika on riittävä.
Talvella, jos lämpötilat laskevat alle 2 °C , jotta pakkasrikkoumia ei pääse syntymään, vesilinjat suljetaan ja järjestelmä tyhjennetään vedestä.
